Em uma noite escura na cidade de Nova York, Ryu é perseguido e atacado por assassinos. Depois de eliminá-los, ele encontra um I.D. cartão para a Friedman Company. No dia seguinte, é anunciado que o Dr. Ned Friedman descobriu uma cura para o câncer. Mas depois de não fornecer nenhuma informação em sua coletiva de imprensa, uma repórter chamada Sarah decide investigar com a ajuda de seus amigos Robert e Jeff. Ao passar pela casa do Dr. Friedman um dia, Ryu ouve a voz de uma jovem pedindo ajuda. Quando Sarah e sua comitiva investigam a casa também, eles encontram seu colega, Ryu. Depois disso, eles descobrem o Dr. Friedman tem conduzido experimentos em humanos vivos usando biotecnologia, e isso pode ter algo a ver com o poder dos Deuses Malignos, que Ryu derrotou no passado. Mas quando a amiga de Ryu, Irene, é sequestrada, ele deve descobrir seu papel como um Dragon Ninja mais uma vez para derrotar esse novo inimigo e salvá-la.