O ano é 2002, e o Marine Express, o primeiro trem subaquático entre a América e o Japão, está pronto para sua viagem inaugural. O engenheiro-chefe suspeita que o teste do trem será usado para fins ilícitos e contrata o detetive particular Ban Shunsaku. Ele chega à mansão de seu cliente apenas para descobrir que acabou de ser assassinado. Armado com apenas um vislumbre do rosto do assassino, Shunsaku embarca no Marine Express para chegar ao fundo desse mistério. Este trabalho, no entanto, é muito mais do que ele esperava, pois o trem guarda segredos além da imaginação de qualquer pessoa.