O jogo se passa no continente de Babel, onde a Torre de Babel paira sobre sete nações. Depois que a invenção da alquimia levou ao seu uso como uma ferramenta de guerra que levou a humanidade à beira da extinção, as sete nações alcançaram uma paz inquieta que levou à proibição da alquimia por centenas de anos desde então. No Ano Continental de 911, a nação de Lustrice quebrou o pacto reunindo um exército reforçado pela alquimia, com ambições de conquistar o continente. Liderados por Envylia, as seis nações se aliaram e derrubaram a nação desonesta, lançando a alquimia mais uma vez na escuridão. Mas 20 anos após a guerra, a alquimia mais uma vez começa a causar o caos na terra.