Ninjas com limites de linhagem começam a desaparecer em todos os países e a culpa aponta para a nação do fogo. Por ordem de Tsunade, Kakashi é sacrificado para evitar uma guerra total. Depois de herdar os encantos deixados por Kakashi, Naruto luta através de amigos e inimigos para evitar sua morte enquanto muda a mente daqueles que herdaram a vontade do fogo.