Depois de se deformar a anos-luz da Terra, a espaçonave Macross carrega uma cidade de civis e soldados de volta para casa. Eles lutam continuamente contra a ameaça dos Zentradi e Meltrandi, raças alienígenas gigantes com as quais a humanidade trava guerra. Durante uma batalha, o Macross se transforma em um mecha operado pelo piloto de caça Hikaru Ichijou. Empurrado em uma série de dificuldades, Hikaru cresce perto do ídolo da cidade Minmay Lynn. À medida que seu relacionamento se desenvolve, no entanto, é visto desfavoravelmente por outros devido ao status e popularidade de Minmay. Com a guerra em andamento e o estado da Terra desconhecido, Hikaru e seus companheiros lutam contra seus misteriosos inimigos. Ao longo do derramamento de sangue, Hikaru e Minmay tentam manter seus sentimentos um pelo outro. Minmay derrama seu coração em sua música, o que pode ser a chave para encontrar a paz.