Terceira rota de Fate/stay night. A Guerra do Santo Graal: uma batalha violenta entre magos em que sete mestres e seus servos lutam pelo Santo Graal, um artefato mágico que realiza qualquer desejo do vitorioso. Cerca de 10 anos atrás, a batalha final da Quarta Guerra do Santo Graal devastou a cidade de Fuyuki, levando 500 vidas e deixando a cidade em escombros. Emiya Shirou, sobrevivente dessa tragédia, aspira se tornar um herói da justiça como seu pai adotivo e salvador, Emiya Kiritsugu. Mesmo sendo só um estudante, Shirou é jogado na Quinta Guerra do Santo Graal quando ele acidentalmente vê uma batalha entre Servos na escola e invoca sua própria Serva, Saber. Quando uma sombra misteriosa começa uma série de assassinatos em Fuyuki, ele se alia com Tohsaka Rin, também participante da Guerra do Santo Graal, para impedir a morte de inúmeras pessoas. Entretanto, os sentimentos de Shirou por sua amiga, Matou Sakura, o levam ainda mais fundo nos segredos obscuros da guerra e das família envolvidas nela.