Em uma tarde chuvosa, os Detective Boys testemunham um assassinato do outro lado da rua. Bloqueado pelo trânsito, o culpado foge e Conan Edogawa recebe uma única pista de um detetive moribundo. Dias depois, outro detetive é encontrado assassinado em um estacionamento, deixando a polícia abalada. Suspeito de que o culpado seja um deles, todos no departamento de polícia sem álibi são suspeitos. Mas apesar de estar em alerta máximo, eles são superados e sofrem mais um ataque – desta vez com Ran Mouri se encontrando no fogo cruzado. Traumatizado, Ran acorda no hospital com amnésia retrógrada, sem se lembrar de nada sobre sua vida. Logo lançado, ela luta para se lembrar de seu passado e fica com medo de não recuperar suas memórias antes de ser alvo do assassino pelo que testemunhou. Como ela é guardada por amigos e familiares, cabe a Conan juntar as pistas e descobrir quem é o assassino antes que eles ataquem novamente.