A história se passa no ano 300 da Era dos Deuses. Yuuki Yuuna vive uma vida normal como uma segundanista do ginasial, mas também é um membro do Clube dos Heróis. Ao lado de suas amigas, também membros do clube, ela se voluntaria a fazer tudo o que pode para ajudar o máximo de pessoas possíveis. O que não sabia, contudo, é que o Clube dos Heróis possuía uma tarefa ainda mais arriscada: derrotar monstros chamados de Vértices, os inimigos da humanidade, a fim de proteger o mundo e evitar que tais seres o destruam. Mas essa luta terá um preço que Yuuna e suas amigas sequer conseguem imaginar.