Shuuji e Chise são estudantes do terceiro e estavam começando a namorar, eles viviam em Sapporo, num Japão em guerra. No entanto, quando Chise vltava para casa, estava sendo seguida por um grupo de homens do governo. No dia seguinte, Shuuji e alguns colegas foram para a cidade vizinha para fazerem compras quando, de repente, a cidade é atacada por dezenas de aviões e bombas. E meio da invasão inimiga, uma estranha arma brilhante cruza o céu, destruindo os inimigos do Japão. Entre os entulhos, Shuuji se surpreende ao encontrar sua namorada, Chise, machucada e com vários aparelhos e armas ligados a seu corpo.