Depois de resolver o incidente das sementes de joia espalhadas, Nanoha Takamachi felizmente retorna à sua vida cotidiana, embora agora com prática de magia adicional pela manhã. Trocando mensagens de vídeo com Fate Testarossa e a tripulação do Arthra, Nanoha aguarda ansiosamente a chance de falar pessoalmente com eles novamente. Mas enquanto estudava em seu quarto um dia, Raising Heart de repente chama Nanoha e a avisa sobre um ataque.