Misaki Suzuhara, de 12 anos, acaba de se envolver no Angelic Layer, um jogo de luta que usa bonecos eletrônicos chamados anjos. Mesmo como uma novata, Misaki mostra habilidades avançadas ao conhecer novos amigos e entrar nos torneios da Camada Angelical para lutar contra os maiores campeões da Camada Angelical da nação.