Chika Homura começa sua carreira no ensino médio com um objetivo: desenvolver uma personalidade de "garota fofa". Depois de deixar o time de vôlei apesar de seu status de estrela, Chika decide se juntar ao subestimado Clube de Instrumento de Sopro da escola e tocar flauta, acreditando ser o instrumento mais delicado e feminino. Pela primeira vez em nove anos, Chika se reúne com sua amiga de infância e total oposto, Haruta Kamijou. Infelizmente para Chika, Haruta não se deixa enganar por seus esforços para se tornar mais cativante. Mas isso não impede Chika, e ela desenvolve uma queda pelo instrutor da banda, Shinjirou Kusakabe. No entanto, a vida escolar de Chika simplesmente não vai de acordo com o planejado. Os membros do clube devem trabalhar juntos para resolver os mistérios que começaram a atormentar de repente a escola, enquanto ao mesmo tempo tentam recrutar mais membros do clube para participar das competições musicais.