Marcus Damon (Daimon Masaru) é um estudante de 14 anos do segundo ano colegial, invicto em batalhas. Embora falte habilidade com computadores e a tecnologia, seu pai é autoridade principal em pesquisa do “Mundo Digital”. Encontra o digimon Agumon, que escapou de DATS, uma organização secreta do governo. Apesar das terríveis primeiras impressões, os dois tornam-se melhores amigos. Com os outros membros do DATS, o trabalho de Masaru e Agumon é investigar vários incidentes envolvendo os Monstros Digitais no mundo real.