Existe uma lenda urbana que fala de um shinigami que pode libertar as pessoas da dor que estão sofrendo. Este "Anjo da Morte" tem um nome - Boogiepop. E as lendas são verdadeiras. Boogiepop é real. Quando um surto de desaparecimentos envolvendo estudantes do sexo feminino irrompe na Academia Shinyo, a polícia e o corpo docente supõem que há apenas um bando de fugitivas em suas mãos. No entanto, alguns alunos sabem melhor. Algo misterioso e sujo sórdido está acontecendo. Será Boogiepop ou algo ainda mais sinistro…?